奧然生物創始人＆CEO余家昌先生、上海國際醫學園區集團有限公司副總經理戴月明先生受浦東電視臺邀約，做客創業故事匯欄目，談論奧然生物的“創業江湖”。該欄目分別于2020年5月14日、5月16日在浦東電視臺及東方財經浦東頻道陸續播出。     01 奧然生物臨危受命，科技抗疫     2020年1月26日晚，余家昌先生接到通知，奧然生物被上海市列為“生產能力緊急征用單位”，公司的即時分子診斷平臺和新冠檢測試劑將被征用于疫情防控。                 02 為何奧然生物科技（上海）有限公司被列為征用單位               此次新冠病毒，傳播快、傳染性強，只有做到即時＊＊檢測，切斷傳染源，才能有效控制疫情，并同時為感染者爭取更多的治愈時間。而傳統分子診斷對實驗室要求高，滿足核酸檢測的實驗室數量少，核酸檢測的覆蓋能力不足，導致核酸檢測效率非常低；核酸檢測時間過長，延誤了感染者的及時確診和救治，同時增加了檢測人員的感染風險。         面對諸多傳統分子檢測的痛點問題，奧然生物顛覆傳統分子檢測模式，創新型的即時分子診斷平臺和新冠檢測試劑，更適用于在多種應用場景開展新冠核酸檢測。在提高核酸檢測即時性和便捷性的同時，杜絕內外源污染，進一步保障生物安全。             03 奧然生物即時分子診斷技術         樣本進，結果出、 操作簡便、 杜絕污染     預裝試劑的智能盒，功能相當于“PCR三間房”，僅需將待測樣本放入智能盒內，運用即時分子診斷平臺（Galaxy系列全自動全密封熒光PCR一體機），智能盒在全封閉的空間內，全自動完成從核酸提取至熒光PCR檢測分析的全流程，快速得到實驗結果。         無需PCR三間房、人員要求低、節省實驗成本、隨到隨檢         04 實現研發到生產的完整工業化流程         奧然生物歷經4年“痛苦”的研發歷程，終于在2019年底實現從研發到生產的完整工業化流程。在此期間，奧然生物申請＊＊64項，43項獲得授權，其中有8項發明＊＊，同時獲得了8項軟件著作權，其自主研發的產品Galaxy Nano全自動全密封熒光PCR一體機（POCT型號）、Galaxy Pro全自動全密封熒光PCR一體機（一次12樣本高通量型號）、新型冠狀病毒（2019-nCoV）核酸檢測智能盒（熒光RT-PCR法）均獲得歐盟CE認證，Universal Nano核酸擴增分析儀獲得三類醫療器械注冊證。     奧然生物獲得階段性的成功離不開整個團隊的堅持和努力，同時也離不開政府和園區給予的大力支持，在此奧然生物深表感謝！         05 即時分子診斷一片藍海，未來可期，仍在努力         即時分子診斷因其一體化，高集成度等特點，對研發企業技術要求高，目前仍處于藍海市場。展望未來，奧然生物在余家昌先生的帶領下，將一直探索核酸檢測的更多可能性，進行分子診斷的應用和創新，為滿足多元化行業需求，＊大化產品價值付出巨大努力。                

　　近日，中科院大連化學物理研究所研究員秦建華領導的研究團隊在以微流控芯片為平臺的模式生物秀麗隱桿線蟲抗衰老研究方面取得新進展, 研究成果被選為封面文章發表在近期Integrative Biology (Integr. Biol., 2014, 6, 35-43)上。白藜蘆醇苷是一種存在于天然植物中的功效成分，是白藜蘆醇的糖苷衍生物，具有保護肝臟、抑制血小板聚集、抗菌、抗病毒、降血脂及抗脂質過氧化等多種藥理作用，但對其抗衰老作用和分子機制等研究尚不清楚。該工作以經典的模式生物秀麗隱桿線蟲為衰老模型，**建立了集單線蟲進樣、長期培養、運動監測、固定及成像多功能的集成化微流控藥物評價平臺，研究考察了天然提取物白藜蘆醇苷對線蟲的抗衰老作用及其機制。研究發現白藜蘆醇苷可在正常和氧化應激條件下顯著延長線蟲壽命，改善其運動行為，并提高其氧化耐受能力。利用特定的轉基因蟲株，發現其延長壽命作用主要與胰島素/胰島素樣生長因子-1信號通路的調節作用有關，它可以正向調節胰島素信號通路中的DAF-16蛋白和下游抗氧化蛋白SOD-3的表達，而對此信號通路中衰老相關基因mRNA表達的研究結果也證實了這一結論。該工作發現了白藜蘆醇苷對線蟲的抗衰老作用及新的調控機制，顯示了微流控芯片用于整體動物水平高通量/高內涵藥物評價的潛力，并為抗衰老藥物的研究和開發提供了一種新的平臺。

據新華社華盛頓5月24日電，美國加州大學戴維斯分校的研究人員日前報告說，他們開發出一種可檢測潛伏性結核病的微流控芯片，其優點是成本更低且更快速可靠。目前對潛伏性結核病檢測主要基于伽馬干擾素，后者是免疫系統細胞制造的一種抗病化學物質。目前市面上常用的檢測方法要求將送檢者的血液樣品交給實驗室，而且樣品通常只能使用一次。研究人員將能與伽馬干擾素結合的一小段單鏈DN**段涂在一片金晶片上，然后將這個晶片植入芯片中，后者含有為血液樣本準備的微小通道。如果伽馬干擾素存在于血樣中，它就會與DNA結合，并觸發一個可被醫生讀取的電信號。因此，如果芯片讀出高濃度的伽馬干擾素，送檢者即可被確診為潛伏性結核病患者。研究人員說，已就這一技術申請＊＊，并希望美國食品和藥物管理局能批準這一新的檢測技術投入使用。

新華網重慶８月２７日電（記者周凱）隨著單獨兩孩政策在各地的落實，高齡產婦數量增加，及時進行孕前檢查對于降低出生缺陷、提高人口質量至關重要。記者從第三軍醫大學西南醫院了解到，國家批準第二代基因測序診斷產品注冊后，部分醫院已開展產前基因檢測項目，可有效降低出生缺陷率。為避免唐氏綜合征等染色體異常所導致的疾病患兒的出生，按照傳統方法，孕婦需要在產前進行血清學篩查，若胎兒患病率高還要進行羊水穿刺。長期從事胎兒疾病診斷與宮內干預研究的第三軍醫大學西南醫院婦產科主任梁志清教授介紹，這一傳統篩查技術準確率相對較低，羊水穿刺又有流產的風險，而產前基因檢測技術具有**、安全、無創、無需穿刺等優勢，可提高出生缺陷篩查率，進而避免出生缺陷。此前，國內很多醫院都開展了產前基因檢測項目，但由于基因測序設備和技術未經審批，存在濫用、夸大效果等問題和倫理風險，今年２月相關部門“叫?！绷怂械幕驕y序臨床應用。７月２日，國家食品藥品監督管理總局批準了華大基因第二代基因測序診斷產品注冊，包括兩款基因測序儀、兩款檢測試劑盒。西南醫院婦產科產前診斷中心主任姚宏教授介紹，第三軍醫大學西南醫院與華大基因合作，運用已取得資質的設備與試劑正式開展無創產前基因檢測、孕前１２項單基因病等項目，可針對孕前期、孕早期、孕中期受檢者，直接檢測如地中海貧血癥、白化病等單基因遺傳性疾病。目前每天來做產前基因檢測項目的產婦有２０多人，知道這一技術的產婦逐漸增多。姚宏教授表示，盡管產前基因檢測技術的成熟度和可信度沒有問題，但由于在我國臨床運用時間不長，掌握這一技術的醫護人員較少，此外這一檢查項目費用偏高，在２０００元左右?！爱a前基因檢測是防治出生缺陷的先進技術，隨著覆蓋面的擴大，檢查費用會逐步降低，將會讓更多的產婦受益?！币暾f。

當“天河二號”以每秒33.86千萬億次浮點運算速度再次榮登全球超級計算機500強排行榜榜首的時候，我一直有兩個疑問：一是33.86千萬億次計算能力是不是通過增加服務器數量就可以實現，有沒有這么簡單？第二什么應用需要如此強大并行計算能力，所謂計算能力是不是一個數字游戲?；蜓芯亢统売嬎銠C如今，這兩個問題都有了答案。首先要實現千萬億次浮點運算不是那么簡單的。以天河二號為例，參與LINPACK測試的節點有16000個，耗時5個多小時，在這個過程中，只要有一臺服務器出現故障，測試就會宣告失敗。這意味著如果節點服務器的故障率是萬分之一，1.6萬臺節點服務器就意味著測試100%不會成功。因此，參與運算的機器數量越大，失敗的風險越高。另外，節點之間的網絡延時、效率都是問題?？傊?，要構建一臺千萬億次超級計算機還是有很多技術難點要克服。

殘疾人聯合會和華大基因共同舉辦的遺傳咨詢沙龍現場，專家為受檢者提供了遺傳咨詢和報告解讀，并對其中部分患者進行家系驗證，輔助疾病的診斷。此次活動是雙方合作“預防出生缺陷—關愛，從了解開始”系列活動的一站，旨在面向有聽力障礙和視力問題的兒童及家屬普及科普知識，提高其對基因與健康的認知度。我國出生缺陷發生率高達5.6%，是導致兒童和成人殘疾的主要原因。出生缺陷患兒會出現生長發育遲緩，智力發育遲緩，特殊面容，肢體以及內臟器官畸形等臨床表現。給家庭和社會帶來了嚴重的經濟負擔和精神負擔。相關負責人介紹，他們希望通過現有的科學技術，幫助這些有遺傳性疾病的患者和家庭盡一份微薄之力?；顒訛椴糠只颊呙赓M提供聽力和眼科的基因檢測，希望通過基因檢測及數據解讀發現致病基因。不僅可以輔助疾病的診斷，也可了解自身致病基因攜帶情況，及早干預。同時，活動還為有生育需求的遺傳病患者及遺傳病家族史成員，提供遺傳咨詢及健康生育指導，從而更加有效地防止或減少嬰兒出生缺陷的發生。

深圳國家基因庫研究團隊成功研發出一套基于第二代高通量測序技術，用于混合樣本的線粒體基因組測序方法。該方法具有低成本、高通量的特點，極大的提高了大規模獲取動物線粒體基因組的效率,該研究成果于2014年10月7日在線發表于《Nucleic Acids Research》雜志。這套流程為國家基因庫萬種線粒體基因組計劃（MT10K）奠定了技術基礎。 后生動物的線粒體具有進化快、豐度高，遺傳模式簡單等優點，線粒體基因組也都具有保守緊湊的結構特點，因此很多線粒體基因——尤其是細胞色素C氧化酶I亞基COI基因片段作為條形碼被廣泛用于物種的分類和鑒定。近年來，DNA宏條形碼技術（DNA metabarcoding）發展迅猛，被廣泛應用于生物多樣性研究，大大縮短了生態學研究周期，顯著提高了生物多樣性調查效率，而線粒體數據庫的全面建立將極大地促進生物多樣性研究的發展，全面開啟線粒體宏基因組（mito-metagenomics）生物多樣性研究的時代，為生態學研究提供更全面地第一手資料。 線粒體全基因組在生物進化的研究中也具有獨特的優勢。由于線粒體有著與真核生物長期共生的進化歷史，因此其基因組包含了反映物種進化的關鍵信息，同時，相對于核基因組，線粒體基因組小，容易對大量物種進行橫向的比較分析，有利于生物進化的研究，因而受到進化生物學家的鐘愛。線粒體的組成可以從兩個層面上反映物種及群體的遺傳和進化，即核酸序列和基因組的結構特征，兩者的特征具有不同的進化機制和進化速度，在進化生物學研究中可以很好的互補。另外，線粒體是真核生物的重要細胞器，是生物體的能量工廠，對生物的生理活動起著至關重要的作用，因此也是細胞核與線粒體協同進化的重要分子標記。全面而完善的線粒體全基因組數據庫能夠為系統發育、進化及其生理功能研究提供重要的支持。 傳統線粒體全基因組的獲取依賴于PCR和疊瓦式測序，成本高、效率低，隨著測序技術的發展，序列獲取效率大大的提高了，但文庫制備成本一直居高不下，難以推進大量物種線粒體基因組測序，而已有混合測序的嘗試也僅局限于少數幾個物種。國家基因庫的研究團隊在周欣博士的帶領下經過兩年的技術研發，**成功混合測序并組裝獲得49個物種的線粒體基因組。新方法將49個物種DNA混合，無需PCR，僅制備一個文庫進行測序，節省了大量建庫成本；先進整合的信息分析流程成功產出49個線粒體基因組并一一歸類到每個物種，其中36個長達15 kb以上，包括20個完整線粒體基因組，剩余13個都長于10 kb；百余條序列利用Sanger序列法嚴格驗證了新方法所得序列的可靠性。 在已發表的文章中，研究團隊的論證表明利用新的方法，DNA質量好壞對線粒體基因組獲得影響不大，即使降解嚴重如博物館陳舊標本的樣品也有可能適用于該方法，這是十分振奮人心的消息。另外，在49個物種中，3種果蠅也成功獲得線粒體基因組，表明該方法對混合物種的選擇限制較低，可以用于近緣物種的混合測序。研究團隊指出，新方法可以極大地降低獲取單個線粒體的成本，同樣的測序量或可以用于更多的混合物種，從而進一步降低獲取海量數據的代價，為全面構建線粒體基因組數據庫提供了新的途徑。隨著MT10K項目的開展，國家基因庫將與國內外學者合作譜寫線粒體基因組百科全書。

2014年9月22日，深圳－在非洲亞撒哈拉地區及東南亞地區，真菌培養白蟻在生態系統中扮演了非常重要角色，是植物殘體的主要降解者。在某些地區甚至高達90％的植物殘體由這種白蟻分解。真菌培植白蟻在其腸道微生物及其所培植的真菌（Termitomyces屬）的多步協作下，可以幾乎完全分解植物纖維素。于此，真菌培植白蟻與其腸道微生物及所培養的真菌形成復雜的共生系統。來自哥本哈根大學社會進化研究中心以及華大基因的研究人員對一種真菌培植白蟻、其培植的真菌以及白蟻的腸道微生物進行了基因組測序，揭示了這一復雜的共生系統，并對植物纖維素分解相關的基因進行了深入分析。這項研究于今天在PNAS雜志上在線發表。這些白蟻通過一種高度結構化的分工協作方式來管理它們的真菌種植園。年齡較大的工蟻負責采集植物材料并將其運回巢穴。年齡較小的工蟻將植物混著真菌的孢子一起食用，然后把消化后剩下的植物和孢子的混合物排泄到真菌種植園中。種植園中的真菌利用這些白蟻提供的植物底物迅速生長，當其生長到一定程度后被年齡較大的白蟻食用。至此，所采集植物中的有機物質幾乎都完全被降解。通過研究發現，所有已知的糖類水解酶中有86%都能在這種白蟻－真菌的共生關系中找到。其中，真菌的基因組編碼了一些負責分解復雜碳水化合物的基因，而腸道微生物主要提供了*終寡糖降解相關的酶。因此，白蟻第一次消化時主要是將真菌孢子接種在植物底物上，而腸道菌群則在第二次消化時扮演了主要的分解任務。白蟻的巢穴由一對白蟻王白蟻后飛離原來的巢穴后建立。建巢之后蟻王蟻后會蛻去翅膀并終身居住在地下的“＊＊”里。隨著蟻群的逐步擴大，蟻后會變成一個體型巨大的產卵機器。白蟻蟻王蟻后通?？梢陨鎺资?，它們管理著壽命較短的工蟻和兵蟻來維持龐大蟻群所需的各種職能。這項研究中的宏基因組分析表明，白蟻蟻后腸道相比于工蟻含有高度簡化的菌群，而且缺少降解植物的所需的酶。這說明白蟻蟻王蟻后不需要承擔降解植物的工作，而是由工蟻喂養真菌來存活。來自華大基因研究院的共同第一作者胡皓夫表示：“由于和真菌的共生關系，真菌培植白蟻是一類非常獨特的物種。通過對白蟻基因組、腸道菌群和它們的共生真菌的測序和分析，我們可以對這種白蟻在腸道細菌和真菌的幫助下降解植物的獨特方式有了更多的了解?！?nbsp;本世紀以來工業界投入了大量的資金用于研究如何利用纖維素來生產可分解的糖類作為綠色能源。但設計一個逐步分解纖維素的生產過程一直以來仍是一個巨大挑戰。這一過程需要多種不同微生物相互協作分解原始的有機物并產生能源，并產生極少的廢料。與人類社會的運轉相似，形成系統的分工協作是完成這一復雜工程的關鍵。通過自然選擇，這個難題在真菌培植白蟻身上被解決了。在這個由白蟻操作的生物反應器中，真菌參與有機物降解的粗加工，白蟻的腸道微生物作為補充從而完成了**的降解工作。不僅如此，它們在這一過程中程度的降低了廢料的產生。值得一提的是產于我國云南的美味可口的雞樅菌就是這類白蟻培育的真菌的子實體。

由美國Salk研究所、深圳華大基因研究院和中科院生物物理研究所等中外科學家組成的研究團隊近日宣布，他們通過利用全基因組測序(WGS)明確了現有疾病基因組靶向矯正工具的安全可靠性，并突破性的創建了新型人類遺傳突變修復工具telHDAdV，為今后以干細胞為基礎的基因治療提供了重要的理論依據。相關的研究成果發表于2014年7月3日的《Cell Stem Cell》雜志上。人誘導多能干細胞技術(iPSC)是近來科研界的一大熱點。所謂iPSC技術，就是利用病毒載體將轉錄因子轉入分化的體細胞中，誘導細胞重新編程從而獲得類似于胚胎干細胞的自體干細胞的技術。這一成就榮獲了2012年的諾貝爾生理學獎。目前，iPS干細胞在體外已成功地被分化為神經元細胞、神經膠質細胞、心血管細胞和原始生殖細胞等，在神經系統疾病、心血管疾病等臨床疾病治療中具有巨大的應用介值。而且iPS干細胞不需要使用卵細胞或者胚胎，這在技術上和倫理上都更有優勢。在本項研究中，研究人員**綜合利用HDAdV，TALEN和CRISPR三種不同的方法，對鐮刀形細胞貧血癥患者iPSC中發生突變的血紅蛋白基因(HBB)進行靶向矯正。研究結果表明這三種基因矯正方法對于HBB基因具有類似的打靶效率。此外，研究人員還通過全基因組深度測序發現TALEN和HDAdV在基因矯正過程中能**限度地保持了病人基因組的完整性，因而是十分安全可靠的。之后，研究人員通過整合TALEN和HDAdV，創建出一種新型的疾病基因矯正載體telHDAdV。telHDAdV同時具有TALEN的特異性基因組切割和HDAdV的高導入效率及精確的大片段同源重組效率。在一個telHDAdV上，可以有效涵蓋HBB基因座上所有可能包含的遺傳突變，因此，telHDAdV可作為一個有效工具來治療包括鐮刀形細胞貧血癥和地中海貧血癥在內的不同種類的血紅蛋白疾病。＊后的實驗結果表明，telHDAdV介導的基因修復比單獨使用TALEN和CPRISPR在效率上約高數十倍。研究人員表示，telHDAdV，作為一個新型遺傳突變修復工具，可在將來被應用于不同種類的人類致病基因突變的靶向矯正。